GATE para Windows

Name: GATE
Rating: 4 (1 reviews)
Author: Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan

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Descripción del desarrollador

By Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan

Analizar y visualizar datos de expresión de series temporales de alta dimensión.

GATE (Análisis de Redes de Expresión de Series Temporales) es una plataforma de software computacional integrada para el análisis y la visualización de series temporales biomoleculares de alta dimensión. GATE utiliza un algoritmo de agrupamiento basado en correlación para organizar series temporales moleculares en una matriz hexagonal bidimensional y colorea dinámicamente hexágonos individuales según el nivel de expresión del componente molecular al que están asignados, para crear películas animadas de la dinámica regulatoria molecular a nivel de sistemas. Con el fin de inferir posibles mecanismos de control regulatorio a partir de patrones de correlación, GATE también permite la interrogación interactiva de películas contra una amplia variedad de conjuntos de datos de conocimiento previo. Las películas de GATE se pueden pausar e interactuar, permitiendo a los usuarios reconstruir redes y realizar análisis de enriquecimiento funcional. Las películas creadas con GATE se pueden guardar en formato Flash e insertar directamente en archivos de manuscritos PDF como figuras interactivas.