Unipro UGENE para Windows

Ugene de Unipro es una herramienta gratuita de modelado y visualización en bioinformática. Puedes utilizarla para visualizar, analizar y anotar secuencias de ADN y proteínas. Es ampliamente compatible con una variedad de plataformas, herramientas y métodos, e incluye una herramienta de alineación Muscle integrada, el paquete Hmmer2 integrado, un visor OpenGL para estructuras macromoleculares PDB y un diseñador de flujos de trabajo personalizado.

Configurar Ugene no es difícil, aunque gran parte de lo que hace depende del acceso a otros archivos y herramientas. Las funciones de Ugene se basan en Proyectos, Tareas y Registros. En la Configuración de la Aplicación, podemos configurar todo, desde la asignación de recursos del sistema hasta la configuración de OpenGL y CUDA (solo para tarjetas gráficas Nvidia). El menú de Herramientas Externas nos permitió establecer cómo Ugene interactúa con las herramientas de información genética con las que es compatible, como Blast, Bowtie, ClusatlW, MrBayes y T-Coffee. También hay una opción para monitorizar máquinas remotas.

Rápidamente nos encontramos desbordados con Ugene, aunque no porque el programa sea difícil de usar de ninguna manera, sino porque nos faltaban dos cosas críticas: conocimiento detallado de genética y acceso a secuencias, modelos y datos existentes. La mayoría de las herramientas que probamos requieren datos para crear visualizaciones, y obviamente las funciones de análisis del programa requieren algo que analizar. Pero Ugene también ofrece una considerable documentación y asistencia, tanto local como en línea, comenzando con el manual del usuario basado en PDF. Ugene también incluye un Manual del Diseñador de Flujos de Trabajo y un Manual del Diseñador de Consultas. Su sitio web ofrece un foro comunitario, soporte en línea y servicios de soporte gratuitos y comerciales, así que hay algo para todos, desde estudiantes empobrecidos hasta laboratorios de élite. Nos impresionaron las capacidades de Ugene para ofrecer a científicos y estudiantes una solución de modelado genético flexible y gratuita en la vanguardia de la biología. La mayoría de los usuarios que pueden hacer buen uso de Ugene podrán ver de un vistazo lo que puede hacer por sus estudios o investigaciones.