¿Has usado SPInDel workbench para Windows?


Análisis de SPInDel workbench

Contenido asistido por IA ·

No escrito por el personal de CNET.

SPInDel Workbench is a free educational software designed for Windows that serves as a reference tool for genetic analysis. It focuses on identifying single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertions/deletions (InDels) within genetic sequences. This program is particularly useful for researchers and educators in the field of genetics, offering a user-friendly interface to streamline the analysis process.

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The software supports various functionalities, including the ability to visualize genomic data and compare sequences effectively. SPInDel Workbench is equipped with tools that facilitate the identification and annotation of genetic variations, thus enhancing the understanding of genetic diversity and evolution. Its extensive features and capabilities make it a valuable resource for those engaged in genetic research.

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Especificaciones completas

GENERAL
Lanzamiento
Última actualización
Versión
1.3
SISTEMAS OPERATIVOS
Plataforma
Windows
Sistema operativo
  • Windows 7
  • Windows 8
  • Windows Vista
  • Windows 10
  • Windows XP
POPULARIDAD
Descargas totales
2
Descargas de la última semana
0

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Programa disponible en otros idiomas


Últimas actualizaciones


Descripción del desarrollador

By GEPO
Adquirir un método para la identificación de especies en todos los dominios de la vida utilizando análisis multiplex.
El SPInDel es un enfoque alternativo para la identificación biológica basado en la longitud de las regiones del gen del ARN ribosómico (rRNA). En general, los alineamientos de las secuencias del gen rRNA primario de diferentes especies muestran regiones alternas de conservación y variación de nucleótidos, tanto en términos de sustituciones de nucleótidos (comúnmente llamadas "SNPs") como de eventos de inserción/borrado (indel). La presencia de indels resulta en secuencias de diferentes longitudes e introduce huecos en el alineamiento, que típicamente se denotan con un guion "-".Nuestro concepto para la identificación biológica utiliza secuencias del gen rRNA de la siguiente manera: las regiones conservadas se utilizan para definir segmentos variables ("regiones hipervariables SPInDel") en los que una combinación de longitudes de secuencia es característica de cada especie (un "perfil SPInDel"). Así, cada especie puede definirse por un perfil numérico único.En teoría, una encuesta de solo 6 regiones hipervariables con 20 alelos cada una (o 11 regiones con 5 alelos cada una) es suficiente para discriminar todas las especies eucariotas en la Tierra, que se estima que son entre 5 y 15 millones en número. En la práctica, SPInDel es capaz de discriminar el 93.3% de las especies eucariotas con baja variación intraespecífica y alta resolución filogenética.

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El equipo editorial de CNET no participó en la creación de este contenido. Las opiniones, análisis y reseñas no fueron proporcionados por CNET.