MultiGeneBlast para Windows

Name: MultiGeneBlast
Rating: 4 (1 reviews)
Author: MultiGeneBlast

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Descripción del desarrollador

By MultiGeneBlast

Identificar homólogos de módulos de múltiples genes como operones y grupos de genes.

MultiGeneBlast es una herramienta de código abierto basada en un reformateo de los encabezados FASTA de las entradas de proteínas de NCBI GenBank, con la que se puede rastrear su nucleótido de origen y coordenadas. MultiGeneBlast puede ayudar en la detección de tales partes multigénicas para proyectos de biología sintética. Se puede crear una biblioteca sintética de operones basada en su salida para identificar aquellos operones cuya función sea la más cercana a la deseada por el usuario. Esta herramienta ofrece oportunidades para identificar todas las regiones genómicas homólogas combinando los resultados de ejecuciones individuales de BlastP en cada gen, y clasificando las regiones genómicas de cualquier entrada de GenBank según el número de coincidencias, la conservación de la sintenia y la puntuación acumulativa de Blast. Se pueden realizar búsquedas de arquitectura para encontrar cualquier región genómica con coincidencias de Blast a cualquier combinación de secuencias de aminoácidos especificada por el usuario.