GenoSuite para Windows

Name: GenoSuite
Rating: 4 (1 reviews)
Author: Dhirendra Kumar

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Descripción del desarrollador

By Dhirendra Kumar

Realizar un análisis proteogenómico y combinar los resultados de múltiples algoritmos.

GenoSuite es un marco desarrollado para el análisis proteogenómico. Se utiliza una estrategia basada en FDRScore para integrar resultados de múltiples algoritmos de búsqueda. La Herramienta Proteogenómica Procariótica (PPT) se ha desarrollado como parte del marco de GenoSuite. PPT está diseñada para encontrar traducciones novedosas en genomas procarióticos y depende de datos de proteómica basados en espectrometría de masas y la secuencia genómica relacionada. Las características incluyen la configuración de 4 algoritmos de código abierto para realizar búsquedas en bases de datos para la identificación de péptidos, y se puede elegir cualquier combinación de los 4 algoritmos, lista de péptidos específicos de búsqueda genómica (péptidos novedosos), coincidencias espectrales que se pueden visualizar para la evaluación de calidad, lista de proteínas novedosas y cambios en las anotaciones de proteínas existentes, y también se puede generar un contexto genómico visual de los péptidos novedosos.