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Detalles clave de compsortall
- compara moléculas para determinar las conformaciones más similares
- Última actualización el
- Ha habido 3 actualizaciones
- Estado de análisis de virus:
Limpio (es muy probable que este programa de software esté limpio)
Descripción del desarrollador
Herramienta de línea de comandos para comparar archivos de datos delimitados por comas utilizando diferencias relativas para determinar las conformaciones más similares. Compsortall compara los archivos de datos utilizando la diferencia relativa, calcula una puntuación de similitud, ordena las puntuaciones fuera de núcleo en orden ascendente (valores más bajos representan mayor similitud), y guarda todas las puntuaciones en un archivo de texto. Los archivos de datos producidos por el usuario deben ser archivos de texto delimitados por comas. Cada archivo representa una molécula única. Cada fila en un archivo representa una conformación única de la molécula. La primera columna en el archivo de datos debe ser una etiqueta única para la conformación representada por la fila. El resto de las columnas son descriptores numéricos, como mediciones de espacio de distancia. Las filas se comparan combinatoriamente entre archivos. Las etiquetas en comparación se concatenan y se guardan con las puntuaciones para el conjunto de filas. Esto proporciona una forma de identificar las conformaciones que produjeron una puntuación de similitud dada.
El trabajo futuro incluye:agregar interfaz GUIpublicar un artículo sobre mi algoritmo de modelado de farmacóforos 3Duna versión paralela utilizando MPI¿Has usado compsortall para Mac? Comparte tu experiencia y ayuda a otros usuarios.