compsort para Mac

Name: compsort
Rating: 4 (1 reviews)
Author: Paul A. Wilson

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Descripción del desarrollador

By Paul A. Wilson

compara moléculas para determinar las conformaciones más similares

Herramienta de línea de comandos para comparar archivos de datos delimitados por comas utilizando diferencias relativas para determinar las conformaciones más similares. Compsort compara los archivos de datos utilizando la diferencia relativa, calcula un puntaje de similitud, ordena los puntajes en orden ascendente (valores más bajos representan mayor similitud) y guarda X número de puntajes bajos. Los archivos de datos producidos por el usuario deben ser archivos de texto delimitados por comas. Cada archivo representa una molécula única. Cada fila en un archivo representa una conformación única de la molécula. La primera columna en el archivo de datos debe ser una etiqueta única para la conformación representada por la fila. El resto de las columnas son descriptores numéricos, como mediciones de espacio de distancia. Las filas se comparan combinatoriamente entre archivos. Las etiquetas en comparación se concatenan y se guardan con los puntajes para el conjunto de filas. Esto proporciona una forma de identificar las conformaciones que produjeron un determinado puntaje de similitud.El trabajo futuro incluye:

añadir interfaz gráfica de usuario
publicar un artículo sobre mi algoritmo de modelado farmacóforo 3D
una versión paralela utilizando MPI