proTRAC para Windows

Name: proTRAC
Rating: 4 (1 reviews)
Author: David Rosenkranz

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Descripción del desarrollador

By David Rosenkranz

Detectar, visualizar y analizar clústeres de piRNA genómicos.

proTRAC es una herramienta única y útil para la detección, visualización y análisis de clústeres de piRNA probabilísticos. proTRAC muestra una mayor sensibilidad y selectividad en comparación con los métodos de detección de clústeres aplicados hasta ahora. Se tiene en cuenta la significación de la densidad de lecturas de secuencia observadas, el sesgo de cadena, la cantidad de loci correspondientes a lecturas de secuencia mapeadas infrecuentemente, la cantidad de loci con T en la posición 1 o A en la posición 10 y la cantidad de loci dentro del rango típico de longitud de piRNA (26-32nt). Las características observadas de los candidatos a clúster se evalúan a la luz del conjunto de datos proporcionado y están sujetas a un sistema de puntuación probabilístico.