Juicebox VR para Android

Por Visoracle
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Detalles clave de Juicebox VR

¡Explora datos de secuenciación del genoma 3D Hi-C en un entorno de realidad virtual!
Última actualización el 19 de diciembre de 2024
Ha habido 9 actualizaciones
Estado de análisis de virus:
Limpio (es muy probable que este programa de software esté limpio)

Descripción del desarrollador

By Visoracle

¡Explora datos de secuenciación del genoma 3D Hi-C en un entorno de realidad virtual!

Juicebox VR crea una representación de realidad virtual de los datos generados por el método Hi-C para la secuenciación del genoma tridimensional. Cada posición 2D en el paisaje corresponde a un par de posiciones 1D, o loci, en el genoma humano de tres mil millones de letras. La altura en la posición 2D representa con qué frecuencia los dos loci están en contacto en el núcleo de una célula. Dado que los loci cercanos suelen chocar entre sí, una enorme 'pared' de contactos a corta distancia biseca el paisaje. Los mesetas cuadradas que salen de la diagonal corresponden a dominios genómicos condensados, llamados dominios de contacto. Los picos en el paisaje corresponden a bucles en el genoma. Los dominios de contacto a menudo están demarcados por bucles, que es por lo que los dominios cuadrados frecuentemente tienen picos en sus esquinas. El controlador volará en la dirección en la que mires. Mira hacia arriba para un super salto. Juicebox VR fue creado por Muhammad Shamim, Ido Machol y Erez Lieberman Aiden. Los datos son extraídos de: Suhas Rao*, Miriam Huntley*, Neva C. Durand, Elena Stamenova, Ivan Bochkov, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Omer, Eric Lander y Erez Lieberman Aiden. Un Mapa 3D del Genoma Humano a Resolución de Kilobase Revela Principios de Bucle de Cromatina, Cell (2014).* contribuyeron igualmente. Ten en cuenta que los datos utilizados para generar el paisaje son una región extremadamente pequeña de un mapa completo a nivel de genoma. El mapa de contacto completo para el genoma humano es un billón de veces más grande que este mapa. Aprende más sobre nuestro trabajo en www.aidenlab.org. Música: Ascent de Stellardrone. IMPORTANTE: Para ver correctamente la aplicación, se debe utilizar un visor de realidad virtual, como Google Cardboard, Durovis Dive o Samsung Gear VR. Clasificación de contenido: Todos.