InDelFixer para Windows

Name: InDelFixer
Rating: 4 (1 reviews)
Author: Armin Topfer

Por Armin Topfer
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Descripción del desarrollador

By Armin Topfer

Elimina las inserciones y reemplaza las bases eliminadas con el genoma de referencia.

InDelFixer es un programa en Java para eliminar inserciones o eliminaciones que causan desplazamientos de marco en los datos de secuenciación de nueva generación. En algunos casos, se sabe que la proteína de interés no tiene variantes con desplazamientos de marco. Estos desplazamientos de marco se pueden corregir con un genoma de referencia dado (o múltiples alineaciones en una versión futura). El programa acepta archivos en formato de flujo estándar, archivos FASTA / PacBio ccs, y datos de Illumina en pares como archivos FASTQ.