GenoSuite for Linux

Name: GenoSuite for Linux
Rating: 4 (1 reviews)
Author: Dhirendra Kumar

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Descripción del desarrollador

By Dhirendra Kumar

Realiza un análisis proteogenómico y combina los resultados de múltiples algoritmos.

GenoSuite para Linux es un marco desarrollado para el análisis proteogenómico. Se utiliza una estrategia basada en FDRScore para integrar resultados de múltiples algoritmos de búsqueda. La Herramienta Proteogenómica Procariótica (PPT) se desarrolla como parte del marco de GenoSuite. PPT se utiliza para encontrar traducciones novedosas en genomas procarióticos y depende de datos de proteómica basados en espectrometría de masas y la secuencia del genoma relacionada. Las características incluyen la configuración para 4 algoritmos de código abierto para realizar búsquedas en bases de datos para la identificación de péptidos, y se puede elegir cualquier combinación de los 4 algoritmos, lista los péptidos específicos de búsqueda del genoma (péptidos novedosos), las coincidencias espectrales se pueden visualizar para la evaluación de calidad, lista las proteínas novedosas y los cambios en las anotaciones de proteínas existentes, y también se puede generar un contexto genómico visual de los péptidos novedosos.