FlexS para Windows

Name: FlexS
Rating: 4.4 (1 reviews)
Author: BioSolveIT

Por BioSolveIT
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Descripción del desarrollador

By BioSolveIT

Predice superposiciones de ligandos en tu PC.

FlexS predice la conformación y orientación de uno de los ligandos en relación con el otro. En FlexS, se asume que el ligando de referencia es rígido, por lo que debe proporcionarse en una conformación que sea similar al estado unido. El algoritmo de superposición en FlexS requiere muy poca intervención manual. Puedes integrar este conocimiento en los cálculos con FlexS realizando pasos individuales manualmente. Así, FlexS está diseñado para trabajar de forma interactiva en pares de ligandos, así como para el cribado virtual basado en ligandos. Las dos principales aplicaciones de FlexS son la superposición de ligandos (por ejemplo, para CoMFA/QSAR) y el cribado virtual. Si tienes una proteína y una pequeña molécula que se une a ella (el llamado ligando de referencia) pero no tienes la estructura de la proteína, puedes tomar la estructura de referencia como una huella digital negativa del sitio activo. FlexS determina la similitud entre la estructura de prueba y la estructura de referencia alineándolas. En el cribado virtual, tienes un ligando de referencia y un conjunto de compuestos y estás interesado en priorizar los compuestos para pruebas experimentales.