AlphaTwist se juega en una cuadrícula de 25 cuadrados con una bolsa que contiene 98 letras. Las letras se sacan de la bolsa una por una y se colocan en la parte superior de cualquier columna. El jugador puede reclamar cualquier palabra horizontal o vertical que pase por la letra que acaba de jugar. Cuando se elimina una palabra del tablero, las letras restantes caen para llenar el espacio. El juego termina cuando el jugador llena la cuadrícula o no completa un nivel dentro del límite de tiempo.