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Fundada el 28 de Agosto de 1970, sus socios fundadores son los Doctores Jos Ramrez Degollado como su primer Presidente, Rafael Tinajero Ayala, Javier Elizondo Rivera, Rubn Lpez Reyes, Ramn Boom A, Alberto Ragasol, Enrique Santoyo, Carlos Varas y Alfonso Albarrn.

Difunde la prctica de la especialidad con la Reunin Nacional de Endoscopia como su evento ms importante. Hasta la fecha se han realizado XXXVI Reuniones Nacionales, de las cuales la ltima fue en la ciudad de Cancn, Quintana Ro en Septiembre de 2009.

Se ha instituido dentro de la Reunin Nacional: cursos en vivo, diversos talleres y prcticas de procedimientos en modelos animales. En estos, han participado y seguirn participando profesores nacionales y extranjeros de reconocido prestigio. Adems se cuenta con el aval de estos cursos por parte de la Sociedad Americana de Endoscopia Gastrointestinal (ASGE), de la Sociedad Interamericana de Endoscopia Digestiva (SIED), de la Organizacin Mundial de Endoscopia Digestiva (OMED), del Colegio Americano de Gastroenterologa y de la Asociacin Americana de Gastroenterologa (AGA).